扬州市疾病预防控制中心是在市卫生局领导下的副处级全民事业单位（同时挂扬州市卫生检测中心牌子），组建于2003年1月，是负责全市疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术指导与应用研究、科学研究的技术服务中心，现有卫技人员200余人，其中高级职称占25%以上，中级职称占50%，也是市卫生局、市药监局、市安监局、市人社局指定的专业体检机构，具有市区*的职业性健康检查资质，专业从事食品、公共场所从业人员，职业人员，放射工作人员，特殊工种作业人员，职业药师，学生，家政服务人员，退休职工和社会各界人员的健康检查。
扬州市医学检验中心成立于1985年，是市卫生局下属的公益性全民事业单位，是全市*高的临床医学检验权威专业机构，负责全市临床检验质量控制、医院检验科室业务管理、临床检验教学与培训、科学研究等工作；中心现有检验技术人员42人(其中高级职称占20%，中级职称占66%)；拥有一系列国内外先进的高精尖检验仪器，可提供千余项各类临检、生化、免疫、分子生物学、微生物等医学检验服务；运用LIS实验室信息管理系统，实现各地检验数据的实时传递、自动控制、综合分析及结果查询，达到国内先进水平。
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