云南省公路科学技术研究院（以下简称：公科院）隶属于云南省公路局正处级事业单位，1985年11月经云南省科委批准成立的技术开发研究机构，2010年经省编办同意更名为云南省公路科学技术研究院，2014年划定为公益二类事业单位，由财政转移支付全额拨款。
公科院现有事业在编职工142人，企业员工1000余人。目前机构设置为5个管理部门：党工部、办公室、总工办、科技经营管理处、资产财务处，8个研究所：道路技术研究所、桥梁技术研究所、隧道技术研究所、试验检测技术研究所、机械化养护技术研究所、岩土工程技术研究所、环境保护工程技术研究所、交通信息与政策研究所， 6个科技服务实体：云南省公路科学技术研究院安全评价中心（交通运输企业安全生产标准化考评机构二级资质）、云南公路工程试验检测中心（公路工程试验检测综合甲级和桥隧专项资质）、云南云路工程监理咨询有限公司（公路工程甲级监理、特殊独立大桥专项监理资质）、云南路建集团股份公司公路工程设计一分院（公路工程勘察设计甲级资质）、云南云路道桥勘察设计有限公司（公路工程勘察设计乙级资质）、云南兴业交通科技开发有限公司（公路工程勘察设计丙级资质）,云南公科路桥工程技术有限公司（公路养护工程一类资质）。
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