上海市水产研究所建于 1978 年，1980年成立了上海市水产技术推广站，所（站）为两块牌子，一套班子，是一家集水产科研、水产技术示范、培训、推广及水产品质量安全检测为一体的公益性事业单位，现隶属于上海市农业委员会。所（站）本部位于上海市杨浦区佳木斯路265号，在奉贤、青浦、江苏启东设有三个科研基地。
40年来，获得*、部级、市级等各项科技成果奖励70余项，其中*科技奖励6项，省部级科技奖励39项，其中一等奖15项，各类专利近百项。近年来，所（站）获得多项荣誉。2015年所（站）主持的《长江刀鲚全人工繁养和种质鉴定关键技术研究与应用》项目获得了上海市技术发明一等奖，2018年合作参与的《长江口重要渔业资源养护技术创新与应用》项目荣获国家科技进步二等奖，2020年合作参与的《中华绒螯蟹新品种选育与产业关键技术集成创新》项目获得了上海市科技进步一等奖，科研成果显着。所（站）自2003年以来获得八届上海市市级文明单位称号。
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