珠江水资源保护科学研究所（简称科研所）成立于1989年，是隶属于水利部珠江水利委员会水文水资源局的二类事业单位，具有独立法人资格。作为珠江流域水资源保护与管理的核心技术支撑机构，其主要职能是开展流域水资源、水生态领域的科学研究、规划管理及重大工程的技术支持，在珠江河口咸潮防控、生态流量保障、流域水生态保护与修复等方向形成了完整的技术体系。
科研所持有全国首批环境影响评价甲级资质、水资源论证甲级资质和水文、水资源调查评价甲级资质，同时具备工程咨询单位乙级资信，并获评广东省环境影响评价编制单位水平评价（5星）*高等级及生产建设项目水土保持方案编制与监测单位水平评价（3星），形成了覆盖环评、水资源论证、水保咨询等多领域的高等级资质体系，为承担国家及流域重大水利工程、水资源规划等业务提供了坚实的专业资质保障。
科研所是自然指数（Nature Index）入选机构，展现了在自然科学领域的高质量科研产出水平。其作为国家自然科学基金依托单位，重点攻关珠江河口咸潮防控、生态流量保障及流域水生态修复等核心技术，近五年主持了多项国家及省部级研究课题，并取得了丰富的学术成果。同时，科研所作为主要完成单位之一，其参与的“大藤峡水利枢纽工程水生态保护与修复关键技术及应用”项目，荣获了2025年度中国大坝工程学会科技进步一等奖。这项历时十余年联合攻关的成果在大藤峡工程中得到成功应用，系统解决了红水河流域梯级开发产生的生态环境累积影响，并产出了多项高质量知识产权。此外，科研所还获得了多项其他省部级及流域级科技奖项，形成了具有行业影响力的核心技术体系，为珠江流域水安全保障提供了强有力的科技支撑。
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