上海市食品研究所成立于1979年，原为应用型科研机构，于2001年1月由事业单位整体转制为国有独资的科技型企业，现隶属于上海建科咨询集团股份有限公司。
整体转制以来，上海市食品研究所始终保持科研机构服务国家与社会的功能，是上海市目前的集食品领域科研开发、食品质量检验检测、食品行业技术服务、食品科学普及和教育培训等多项功能的综合性食品科研机构。
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