1844年,英国伦敦基督教会多次派遣医学传教士进行实地探索、考察,终于在该年2月开设了上海*家西式医院，称为“中国医院”，为仁济医院的前身。1846年，医院迁入当时公共租界近山东路的麦家圈，即现在仁济医院西部的院址，并改名山东路医院，又称“仁济医院”
1952年11月，经华东军政委员会卫生部批准，仁济医院为第二医学院附属仁济医院， 1999年10月，仁济东院建成投入使用，摆脱了长期困扰医院发展的地域限制，医院占地面积由原来的14亩扩大为145亩。床位数由原来的700张增加到1300张。医疗技术力量雄厚，拥有在职正高职称专家117名，副高职称专家281名，年门诊量达到190万人次，住院人数达3万余人次，年手术1.9万余例。
仁济重视学科建设与人才培养。目前，拥有上海市消化疾病研究所、上海市风湿疾病研究所和上海市男科学研究所；拥有上海市*的人类精子库、上海市产科心脏病监护中心、上海市血液透析和激光医学两个质控中心。近年来培育形成了一批技术先进，充满活力的优势学科群。拥有PET-CT、3.0T磁共振、直线加速器等一流设备。承担了浦东地区大部分急救任务。近5年来，申请到局级以上（含局级）科研项目150余项，申请专利23项，其中实用型专利11项，在全国医疗机构中*。 3人获“上海市*人才”称号，28人入选上海市各类人才培养计划。
在全市三级综合性医院中率先推行并通过ISO9001质量管理认证体系。仁济医疗管理有限公司已成功托管江浙沪地区二甲以上共12家医院；涉外全康国际医疗中心为驻沪外籍人士提供*具质量和诚信的医疗保障。
近三年在上海市万人问卷调查中病人满意率处于全市前列。连续七次荣获全国卫生系统先进集体称号，连续八次获上海市卫文明单位称号。
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