自然资源部南海发展研究院（加挂“自然资源部南海遥感技术应用中心”牌子，以下称南海发展研究院，原国家海洋局南海海洋工程勘察与环境研究院、国家海洋局南海规划与环境研究院），成立于2000年3月，是隶属于自然资源部南海局的事业单位，主要开展海洋战略、规划、政策、制度等相关研究和技术支撑工作，承担海洋经济调查监测评估、海洋国土空间规划、海洋资源调查评估、海洋生态保护修复、海洋遥感技术应用与服务等工作。
自成立以来，南海发展研究院持续支撑南海区海域海岛监管技术工作；连续多年承担完成广东省近海海底基础数据调查；牵头完成无居民海岛登记单元试点划定、海岛地籍内业调查和外业核实工作，开展南海区海洋自然资源资产清查核查；承担南海区海洋经济运行监测与评估工作，承担完成《广东省海洋经济“十四五”规划》《广东省海洋公共基础设施专项规划》，参与广东省国土空间规划体系构建，与地方共建了广东省海洋规划研究院、广东省海洋经济运行监测与研究中心；探索实践海区海洋生态保护修复技术支撑，持续推进海洋碳汇理论研究。长期致力开展疏浚泥综合利用等方面科研及推广工作；充分发挥毗邻港澳优势，为港澳海洋资源开发与保护提供技术支持。与国内外的30余家高校和科研机构建立了合作机制，联合开展了多项技术合作。配备了遥感测绘实验室、海洋生态实验室、水文气象实验室、疏浚泥实验室等4个专业实验室，拥有开展科研工作所需的调查设备（包括数字航摄仪、无人机等）、大型监/检测设备和软件，具备*CMA检验检测资质认证；聘请40余位高校、科研院所、企事业单位专家学者为顾问，科研力量雄厚。
2018年10月，南海发展研究院博士后科研工作站经人力资源社会保障部和全国博士后管委会联合批准设立，是自然资源部南海局的*工作站。
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